Divers suivis et recensements sont menés à Nature Comminges, notamment pour les odonates et les papillons.
De 2009 à 2011, Nature Comminges a coordonné pour le Sud de la Haute-Garonne les inventaires pour constituer l’Atlas des papillons de jour de Midi-Pyrénées, coordonné par le C.R.E.N de Midi-Pyrénées, en réalisant plusieurs sorties de prospection et de formation par an.